Simulação Computacional da Interação Fármaco-Receptor
Nível: básico
Público alvo: Pós Graduandos e Graduandos
Número máximo de vagas: 30
Audiovisual necessário para o minicurso: Datashow + Microcomputador (ou laptop) e Retroprojetor
Carga horária: 6 horas
Responsável: Prof. Dr. Anderson Coser Gaudio
Instituição: Departamento de Física, CCE, Universidade Federal do Espírito Santo
Endereço: Campus de Goiabeiras, Vitória, ES, 29.060-900.
Telefone: 0xx-27-335.2483
Fax: 0xx-27-335.2823
E-Mail: anderson@cce.ufes.br
Internet: www.cce.ufes.br/~anderson
PROGRAMA
- Introdução
- Interação Fármaco-Receptor
- Níveis de Estudo da Interação Fármaco-Receptor
- Modelagem Molecular
- Métodos de Cálculo Molecular
- Principais Cálculos Moleculares
- Preparação para a Simulação Computacional
- Simulação Computacional da Interação Fármaco-Receptor
- Estudo de Casos
EMENTA
1. Introdução
1.1 Química Medicinal
1.2 Modelagem Molecular
1.3 Fármacos e Receptores
2. Interação Fármaco-Receptor
2.1. Fundamentos de Farmacologia
2.1.1. Farmacocinética
2.1.2. Farmacodinâmica
2.2. Teorias sobre a Interação Fármaco-Receptor
2.3. Simulação Computacional da Interação Fármaco-Receptor
3. Níveis de Estudo da Interação Fármaco-Receptor
3.1. Fármaco Conhecido e Receptor Desconhecido
3.1.1. Exploração do Campo Molecular do Fármaco
3.1.2. Construção do Modelo Farmacofórico
3.1.3. Construção da Estrutura 3D de Proteínas a Partir da Seqüência de AA
3.1.4. Modelagem de Proteínas por Homologia
3.1.5. Determinação do Receptor Farmacológico na Macromolécula
3.2. Fármaco Desconhecido e Receptor Conhecido
3.2.1. Exploração do Receptor Farmacológico
3.3. Fármaco e Receptor Conhecidos
4. Modelagem Molecular
4.1. Definição e Escopo
4.2. Programas de Visualização Molecular
4.3. Técnicas de Modelagem Molecular
4.3.1. Superposição Molecular
4.3.2. Emparelhamento de Seqüências de Proteínas
5. Métodos de Cálculo Molecular
5.1. Baseados em Mecânica Clássica
5.1.1. Mecânica Molecular
5.1.2. Método de Monte Carlo
5.1.3. Dinâmica Molecular
5.2. Baseados em Mecânica Quântica
5.2.1. Métodos Semiempíricos
5.2.2. Métodos ab initio
5.3. Programas Disponíveis
6. Principais Cálculos Moleculares
6.1. Cálculo da Energia Molecular
6.2. Otimização da Geometria Molecular
6.3. Solvatação em Cálculos Moleculares
6.4. Busca Conformacional
6.5. Cálculo da Energia de Interação Intermolecular
6.6. Simulação da Dinâmica Molecular
6.7. Cálculo da Variação da Energia Livre
7. Preparação para a Simulação Computacional
7.1. Obtenção das Estruturas Moleculares
7.2. Reparo de Macromoléculas
7.3. Ajuste de Cargas
7.4. Encaixe do Fármaco no Receptor
7.5. Adição de Contra-Íons
7.6. Solvatação
8. Simulação Computacional da Interação Fármaco-Receptor
8.1. Simulação Estática
8.1.1. Exploração do Potencial Eletrostático Molecular
8.1.2. Interação entre Orbitais Moleculares
8.2. Simulação Dinâmica
8.2.1. Técnicas de Simulação da Dinâmica Molecular
8.2.2. Condução da Simulação da Dinâmica Molecular
9. Estudo de Casos
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