PARAMETRIZAÇÃO DOS TERMOS LIGADOS DE p-MENTAN-3,9-DIÓIS

 

Adriana M. Namba1 (PG), Gil V.J. da Silva1 (PQ), Carlos Alemán2 (PQ), Gilberto Lúcio B. de Aquino1 (PG)

 

1 Departamento de Química da Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - Universidade de São Paulo

2 Departament de Enginyería Química, ETSEIB – Universitat Politècnica de Catalunya, Barcelona, Espanha

 

palavras-chave: campo de força, parametrização, PAPQMD

 

Os métodos de Mecânica Molecular, Dinâmica Molecular e Monte Carlo consistem de uma ferramenta muito importante quando se deseja obter uma representação precisa das características conformacionais dos sistemas moleculares. Todas estas técnicas são baseadas no fato de que a energia de um sistema pode ser representada como a adição de dois termos clássicos: os termos ligados, os quais incluem as energias de estiramento, de deformação e torcional e os termos não-ligados os quais incluem as interações eletrostáticas, de van der Waals e as ligações de hidrogênio. A confiabilidade dos cálculos depende, principalmente, da qualidade dos parâmetros contidos no campo de força escolhido. No entanto, os parâmetros empíricos contidos nos campos de força limitam-se a apenas determinados sistemas moleculares e isso têm levado, muitas vezes, a resultados errôneos. Nosso interesse está na determinação dos parâmetros de força para os p-mentan-3,9-dióis (1), (2), (3) e (4), utilizando-se uma metodologia que foi desenvolvida para o cálculo de parâmetros de força aproximados e mostrou-se ser bastante viável e de baixo custo computacional. Esta metodologia foi incorporada num programa de computador chamado PAPQMD (Program for Approximate Parametrization from Quantum Mechanical Data). O programa PAPQMD calcula os parâmetros de força através do ajuste da energia mecânica quântica (EMQ), obtida de cáculos semi-empíricos ou ab initio, para a energia (EMM), derivada de cálculos da mecânica molecular

 

As constantes de força de estiramento e deformação (dados em kcal/mol.Å2), as quais estão mostradas na Tabela 1 foram obtidas utilizando-se a estratégia padrão PAPQMD. Para o cálculo do termo eletrostático nós utilizamos a estratégia desenvolvida por Momany, na qual as cargas eletrostáticas (em unidades de elétron) são calculadas através do ajuste do Potencial Eletrostático Molecular (MEP), obtido através de cálculos ab initio. O termo torcional foi parametrizado usando uma abordagem na qual somente a natureza de dois átomos centrais é considerada. Cada parâmetro foi validado comparando-se as geometrias moleculares e os dados termodinâmicos obtidos da mecânica molecular com os obtidos pelos cálculos ab initio.

Tabela 1

Estira/o

kEst

 

rijeq

(Å)

Deformação

kDef

qijkeq

(graus)

Átomo

cargas Diol (1)

cargas Diol (2)

cargas Diol (3)

cargas Diol (4)

CA-CA

432

1.531

CA-CA-CA

85

111.8

C1 (CA)

0.3142

0.3154

0.4483

0.5230

CA-CB

370

1.540

CA-CA-CB

85

113.0

C2 (CA)

-0.2782

-0.3168

-0.3061

-0.4657

CA-CC

387

1.549

CA-CA-CC

82

114.8

C3 (CB)

0.4080

0.3384

0.4273

0.5889

CA-H

364

1.081

CA-CA-H

50

110.2

C4 (CA)

0.0443

-0.0126

-0.3295

-0.2700

CB-H

364

1.089

CA-CB-CA

78

111.2

C5 (CA)

-0.2337

0.0335

-0.0606

0.0812

CB-OH

434

1.414

CA-CB-H

45

108.4

C6 (CA)

-0.1767

-0.2551

-0.1818

-0.2722

CC-CC

354

1.534

CA-CB-OH

84

106.2

C7 (CC)

-0.4971

-0.4676

-0.5720

-0.5143

CC-H

364

1.086

CA-CC-CC

75

114.8

H(-C7)

0.1140

0.1080

0.1260

0.1099

CC-OH

434

1.406

CA-CC-H

65

106.1

H(-C1)

-0.0170

-0.0189

-0.0075

-0.0506

OH-HO

458

0.945

CB-OH-HO

67

110.1

H(-C2)

0.0872

0.1069

0.0693

0.0928

 

 

 

CC-CA-H

51

106.3

O(-C3)

-0.7355

-0.7420

-0.7229

-0.7819

 

 

 

CC-CC-H

53

110.2

H(-O-C3)

0.4212

0.4470

0.4343

0.4651

 

 

 

CC-CC-OH

84

111.1

H(-C3)

-0.0455

-0.0095

-0.0130

-0.0426

 

 

 

CC-OH-HO

67

109.4

C8 (CC)

0.2320

0.2033

0.2704

0.2881

 

 

 

H-CA-H

46

106.5

C9 (CC)

0.2151

0.1221

0.1643

0.1035

 

 

 

H-CC-H

39

107.3

H(-C9)

-0.0050

0.0161

0.0117

0.0320

 

 

 

H-CC-OH

49

109.5

O(-C9)

-0.7487

-0.6863

-0.7155

-0.7305

 

 

 

HO-CB-H

59

107.3

H(-O-C9)

0.4704

0.4459

0.4480

0.4647

 

 

 

CB-CA-CC

85

112.7

C10 (CC)

-0.5336

-0.3325

-0.3640

-05449

 

 

 

CB-CA-H

45

109.2

H(-C10)

0.1210

0.0797

0.0879

0.1267

 

 

 

CC-CC-CC

70

110.6

H(-C8)

0.0039

-0.0510

0.0202

0.0182

 

 

 

 

 

 

H(-C4)

0.0209

0.0294

0.0848

0.0674

 

 

 

 

 

 

H(-C5)

0.0824

0.0146

0.0427

0.0061

 

 

 

 

 

 

H(-C6)

0.0509

0.0595

0.0431

0.0505

Estes resultados indicam que o ambiente químico possui um papel importante na parametrização de estiramento e deformação e que os parâmetros eletrostáticos dependem, não somente da constituição química da molécula, como também de sua estereoquímica. Deve ser enfatizado que estes aspectos não são levados em conta pela maioria dos campos de força.

(FAPESP, CNPq, CAPES)