A SBQ possui 22 secretarias regionais espalhadas por todo o país. As diretorias das secretarias regionais, compostas por um secretário, um vice-secretário e um tesoureiro, com um mandato de dois anos são eleitas pelos sócios efetivos cadastrados nas respectivas secretarias.
A função das secretarias regionais é a divulgação da Sociedade e o atendimento mais próximo dos sócios nas regiões de atuação. Algumas secretarias, isoladamente ou em conjunto com outras, organizam eventos regionais, ciclo de palestras, seminários, etc.
